Skip to main content

Table 2 The Pearson's correlations and standard deviations for intra-method and inter-method comparisons for 739 high intensity genes.

From: A comparison of RNA amplification techniques at sub-nanogram input concentration

Unamp A

Unamp A

                

Unamp B

0.78

Unam p B

               

Unamp C

0.78

0.90

Unamp C

              

Mod T7 D

0.72

0.79

0.78

Mod T7 D*

             

Mod T7 E

0.72

0.80

0.77

0.89

Mod T7 E

            

Mod T7 F

0.73

0.77

0.76

0.90

0.87

Mod T7 F

           

Mod T7 G

0.73

0.77

0.76

0.90

0.86

0.94

Mod T7 G

          

Mod T7 H

0.74

0.81

0.79

0.91

0.87

0.94

0.96

Mod T7 H

         

Mod T7 I

0.78

0.80

0.79

0.90

0.86

0.94

0.95

0.95

Mod T7 I

        

Arcturus J

0.71

0.78

0.77

0.89

0.87

0.89

0.91

0.92

0.90

Arcturus J

       

Arcturus K

0.72

0.80

0.77

0.88

0.87

0.86

0.86

0.88

0.86

0.89

Arcturus K

      

Arcturus L

0.73

0.79

0.79

0.88

0.85

0.86

0.88

0.89

0.88

0.88

0.86

Arcturus L

     

Arcturus M

0.74

0.82

0.80

0.92

0.88

0.88

0.90

0.92

0.89

0.90

0.91

0.93

Arcturus M

    

Bal PCR N

0.72

0.78

0.77

0.85

0.82

0.82

0.83

0.84

0.84

0.82

0.81

0.84

0.86

Bal PCR N

   

Bal PCR O

0.71

0.77

0.75

0.85

0.82

0.80

0.80

0.82

0.82

0.80

0.81

0.82

0.85

0.93

Bal PCR O

  

Bal PCR P

0.66

0.74

0.72

0.83

0.79

0.77

0.78

0.79

0.79

0.76

0.78

0.79

0.83

0.87

0.86

Bal PCR P

 

Bal PCR Q

0.68

0.73

0.72

0.81

0.78

0.76

0.77

0.78

0.78

0.76

0.77

0.80

0.82

0.89

0.90

0.85

Bal PCR Q

 

Intramethod

  

Intermethod Mean R2

         
 

Mean R 2

SD

Range

Unamp

SD

Mod T7

SD

Arcturus

SD

Bal PCR

SD

      

Unamp

0.82

0.06

0.78–0.90

  

0.77

0.03

0.77

0.03

0.73

0.03

      

Mod T7

0.91

0.03

0.86–0.96

0.77

0.03

  

0.88

0.02

0.81

0.03

      

Arcturus

0.90

0.02

0.86–0.93

0.77

0.03

0.88

0.02

  

0.81

0.03

      

Bal PCR

0.88

0.03

0.82–0.93

0.73

0.03

0.81

0.03

0.81

0.03

       Â