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Table 4 Functional annotation of predicted complexes in Table 1(13) and Figure 8 (the code represents functional category)

From: Identifying protein complexes from interaction networks based on clique percolation and distance restriction

Complexes

ORF

   

Protein functional categories

Table 1 (13)

YLR268w

   

20.09.07.03

20.09.07.05

20.09.07.27

  

YKR068c

   

20.09.07.03

     

YML077w

   

20.09.07.03

    

YFL038c

  

14.10

20.09.07.03

    

YGR166w

01.05.25

  

20.09.07.03

    

YDR108w

 

10.03.02

 

20.09.07.03

  

43.01.03.09

 

YBR254c

   

20.09.07.03

    

YDR246w

   

20.09.07.03

    

YDR407c

   

20.09.07.03

    

YDR472w

   

20.09.07.03

    

YMR218c

   

20.09.07.03

    

YOR115c

   

20.09.07.03

    

YIL004c

   

20.09.07.03

 

20.09.07.27

  

Figure 8 (complex197)

YBL084c

 

10.03.01.01.11

14.07.05

14.10

14.13.01.01

16.01

16.19.03

YDL008w

 

10.03.01.01.11

14.07.05

14.10

14.13.01.01

16.01

16.19.03

 

YDR118w

 

10.03.01.01.11

14.07.05

14.10

14.13.01.01

16.01

16.19.03

 

YFR036w

 

10.03.01.01.11

14.07.05

14.10

14.13.01.01

16.01

16.19.03

 

YGL240w

 

10.03.01.01.11

14.07

 

14.13.01.01

16.01

  

YHR166c

 

10.03.01.01.11

14.07.05

14.10

14.13.01.01

16.01

16.19.03

42.04

YKL022c

 

10.03.01.01.11

14.07.05

14.10

14.13.01.01

16.01

16.19.03

 

YLR127c

 

10.03.01.01.11

14.07.05

14.10

14.13.01.01

16.01

16.19.03

 

YNL172w

 

10.03.01.01.11

14.07.05

14.10

14.13.01.01

16.01

16.19.03

 

YOR249c

10.01.09.05

10.03.01.01.11

14.07.05

14.10

14.13.01.01

16.01

16.19.03

 

YLR102c

 

10.03.01.01.11

14.07.05

14.10

14.13.01.01

16.01

16.19.03

 

YIR025w

 

10.03.01.01.11

14.07.05

14.10

14.13.01.01

16.01

16.19.03

 
  1. The Code of Figures Represent Function: 01.05.25: regulation of C-compound and carbohydrate metabolism; 10.01.09.05: DNA conformation modification; 10.03.01.01.11: mitosis M phase; 10.03.02: meiosis; 14.07.05: modification by ubiquitination, deubiquitination; 14.10: assembly of protein complexes; 14.13.01.01: proteasomal degradation (ubiquitin/proteasomal pathway); 16.01: protein binding; 16.19.03: ATP binding; 20.09.07.03: ER to Golgi transport; 20.09.07.05: intra Golgi transport; 20.09.07.27: vesicle fusion; 42.04: cytoskeleton/structural proteins; 43.01.03.09: development of asco-basidio- or zygospore.
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BMC Genomics

ISSN: 1471-2164

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