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Table 5 Polymorphic VNTR discovery found within a cell division gene (fts N) in S. Montevideo using NGS applications.

From: High resolution clustering of Salmonella enterica serovar Montevideo strains using a next-generation sequencing approach

160_Clinical_FL

TGCGTTTGAGCCCACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

206_Clinical

TGCGTTTGAGCCCA-----------------------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

161_Clinical_1993

TGCGTTTGAGCCCA-----------------------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

207_Sunflower

TGCGTTTGAGCCCA-------------------------------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

205_Soup

TGCGTTTGAGCCCA-----------------------------------------CTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

162_Reference

TGCGTTTGAGCCCA-----------------------------------------CTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

163_Clinical_GA

TGCGTTTGAGCCCA-----------------------------------------CTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

221_Clinical_NC_2

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

223_Clinical_NC_1

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

222_Clinical_NC_5

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

220_Clinical_NC_3

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

217_Drain_Swab

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

155_Clinical_NC_4

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

227_Pistachio_1

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

212_King Fish

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

204_Chicken

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

147_Black_Pepper3

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

148_Black_Pepper4

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

142_Pistachio_2

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

224_Clinical_OH_2

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

216_Black_Pepper2

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

215_Red_Pepper_2

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

158_Clinical_MD

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

225_Clinical_OH_1

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

228_Clinical_CT

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

229_Salami_2_CT

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

230_Salami_1_CT

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

233_Salami_CT

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

235_Salami_CT

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

214_Black_Pepper1

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

213_Sea_Trout

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

219_Red_Pepper_1

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

156_Clinical_OH_3

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

209_Romaine

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

237_Meat_IA_1

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

238_Meat_IA_3

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

239_Meat_IA_2

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

240_Meat_IA_4

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

242_Meat_IA_5

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

211_Perch

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

210_Mozzarella

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

236_Clinical_IA

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

157_Clinical_CA

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

144_Black_Pepper6

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

145_Black_Pepper5

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

146_Black_Pepper7

TGCGTTTGAGCCCA---------------CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGCCT

  1. Terminal names correspond to samples in Table 1.