MiRNA family | References | Relative number of reads found in tomato | ||
---|---|---|---|---|
 |  | Mature green | Breaker stage | Red ripe |
Conserved miRNAs | Â | Â | Â | |
miR156 | Zhang J et al, 2008; Yin Z et al, 2008; Moxon S et al, 2008. | 115.99 | 31.95 | 15.14 |
miR157 | Zhang J et al, 2008; Yin Z et al, 2008; Moxon S et al, 2008. | 349.64 | 154.19 | 137.34 |
miR159 | Pilcher et al, 2007; Zhang J et al, 2008; Moxon S et al, 2008. | 59.89 | 48.06 | 82.55 |
miR160 | Pilcher et al, 2007; Yin Z et al, 2008; Moxon S et al, 2008. | 46.06 | 30.28 | 1.44 |
miR162 | Pilcher et al l, 2007; Yin Z et al, 2008; Moxon S et al, 2008. | 878.08 | 929.27 | 167.99 |
miR164 | Pilcher et al, 2007; Moxon S et al, 2008 | 996.58 | 496.45 | 188.53 |
miR165 | Moxon S et al, 2008 | 38.94 | 24.73 | 3.60 |
miR166 | Pilcher et al, 2007; Moxon S et al, 2008 | 2750.64 | 2154.69 | 523.78 |
miR167 | Zhang J et al, 2008; Yin Z et al, 2008; Moxon S et al, 2008. | 265.06 | 209.19 | 8.29 |
miR168 | Pilcher et al, 2007; Yin Z et al, 2008; Moxon S et al, 2008. | 4967.40 | 3130.92 | 62.36 |
miR169 | Zhang J et al, 2008; Yin Z et al, 2008; Moxon S et al, 2008. | 0.84 | 0 | 0 |
miR171 | Pilcher et al, 2007; Zhang J et al, 2008; Moxon S et al, 2008. | 19.68 | 53.61 | 2.16 |
miR172 | Zhang J et al, 2008; Yin Z et al, 2008; Moxon S et al, 2008; Itaya et al, 2008. | 2993.09 | 2733.37 | 798.11 |
miR319 | Zhang J et al, 2008; Yin Z et al, 2008; Moxon S et al, 2008. | 0.42 | 0 | 0 |
miR390 | Moxon S et al, 2008; Itaya et al, 2008. | 97.98 | 46.67 | 2.16 |
miR394 | Moxon S et al, 2008. | 6.70 | 4.44 | 2.16 |
miR395 | Zhang J G et al 2008; Moxon S et al, 2008. | 0.41 | 0 | 0 |
miR396 | Moxon S et al, 2008. | 1300.58 | 2175.81 | 334.89 |
miR397 | Moxon S et al, 2008. | 0.42 | 0 | 0 |
miR399 | Zhang J et al, 2008; Yin Z et al, 2008; Moxon S et al, 2008. | 44.38 | 17.50 | 1.08 |
miR408 | Pilcher et al, 2007, Moxon S et al, 2008 | 0.42 | 0.28 | 0 |
miR472 | Itaya et al, 2008; Moxon S et al, 2008. | 19.26 | 12.78 | 0.36 |
miR482 | Pilcher et al, 2007. | 1.67 | 2.51 | 0 |
miR827 | 2.09 | 6.39 | 14.78 | |
Non-conserved miRNAs | Â | Â | Â | |
miR158 | Â | 2.93 | 1.67 | 0 |
miR161 | Â | 0.42 | 0 | 0 |
miR173 | Â | 0.41 | 0 | 0 |
miR393 | Â | 0.42 | 0 | 0 |
miR398 | Â | 0.40 | 0 | 0 |
miR403 | Â | 210.20 | 138.91 | 27.04 |
miR414 | Â | 0.42 | 0 | 0 |
miR828 | Moxon S et al, 2008. | 0 | 0 | 0 |
miR858 | Moxon S et al, 2008. | 5.19 | 12.31 | 1.22 |
miR894 | Moxon S et al, 2008. | 10.05 | 5.00 | 0.36 |