Skip to main content

Table 3 Functional domains and motifs of soybean Hsfs

From: Genome-wide analysis of the Hsf family in soybean and functional identification of GmHsf-34 involvement in drought and heat stresses

Gene

Subgroup

DBD

HR-A/B

NLS

NES

AHA motif

GmHsf-24

A1

11-104

131-182

(216) KKRR

(257) LQILQI

(399) DEFWELLL

GmHsf-02

A1

17-110

139-190

(224) KKRR

 

(407) DEILQTSV

GmHsf-04

A1

11-114

131-182

(216) KKRR

 

(399) DEFWELFL

GmHsf-17

A1

17-120

149-200

(234) KKRR

 

(446) DEILQTSV

GmHsf-33

A1

27-120

148-200

(233) KKRR

 

(456) DDILRTPV

GmHsf-08

A2

40-133

158-210

(240) RKRR

 

(312) DSVWEDLLN

GmHsf-30

A2

40-133

156-208

(240) RKRR

 

(305) DTILEDFLN

GmHsf-34

A2

39-132

153-204

(240) RKRR

 

(293) DSILEDFLN

GmHsf-07

A3

36-129

148-195

(233) RRRFIK

(156) LESLRKERSVL

(374) KRNTNFDVSG

GmHsf-20

A3

44-137

159-190

(243) VRKN

 

(353) IWDSGLNVSG

GmHsf-28

A3

1-86

105-151

(191) VRKFVK

 

(346) IWDSGLNVSG

GmHsf-11

A4

1-83

100-159

(182) DRKRR

 

(318) DVFWEQFLTE

GmHsf-13

A4

10-103

121-177

(202) DRKRR

 

(338) DVFWEQFLTE

GmHsf-29

A4

11-104

121-190

(205) DRKRR

 

(341) DIFWERFLTE

GmHsf-31

A4

11-104

122-180

(205) DRKRR

 

() DIFWERFLTE

GmHsf-09

A5

12-105

122-149

(204) YKKRR

(347) LTL

(427) DVFWEQFLTE

GmHsf-15

A5

10-103

119-153

(202) YKKRR

(345) LTL

(425) DVFWEQFLTE

GmHsf-21

A6

38-131

153-194

(222) KSK7KKRR

(160) HDKLVL

(297) DEEFWEELLFSE

GmHsf-23

A6

123-216

243-295

(316) WRK7NKKRR

(380) LDLALNL

(414) DEVFWQDLLNE

384-416

GmHsf-22

A6

21-114

140-197

(210) WRK7KR

 

(282) EEVLWEELLNE

GmHsf-37

A6

16-109

135-188

(208) WRK7KKRRR

 

(303) DEVFWQDLLNE

278-300

GmHsf-10

A8

7-100

132-170

 

(281) LSPLEN

 

GmHsf-14

A8

13-106

138-181

 

(287) LSPLEN

 

GmHsf-01

B1

6-99

155-188

(245) KRGR

  

GmHsf-12

B1

8-137

179-216

(303) RKRGR

  

GmHsf-25

B1

7-100

157-190

(248) KRGR

  

GmHsf-35

B1

8-101

144-176

(262) RKRGR

(162) GELAL

 

GmHsf-03

B2

4-97

162-197

(273) LKRCR

(174) LRKENMQL

 

GmHsf-18

B2

30-123

170-200

(261) AKRAR

(186) LTKELAEMRSL

 

GmHsf-19

B2

20-113

164-194

(237) TKRAR

(180) LTKELEEMRS

 

GmHsf-26

B2

21-114

180-213

(294) LKRCR

(197) IQL

 

GmHsf-32

B2

29-122

171-201

(278) AKRAR

(187) LTKELAEMRSL

 

GmHsf-38

B2

20-113

169-195

(242) KKRAR

  

GmHsf-06

B3

17-110

146-185

(206) QGER

  

GmHsf-36

B3

17-112

148-184

(208) QGGR

  

GmHsf-05

B4

31-129

150-190

   

GmHsf-27

B4

34-132

155-194

 

(178) LELQM

 

GmHsf-16

C1

13-106

131-170

(199) KKRR

(142) LKEEQKAL

 
Back to article page

BMC Genomics

ISSN: 1471-2164

Contact us