Table 1 R-genes catalog and conservation in plant genomes

Monocot

Oryza sativa (rice)

12

372

41046

Ref

1180

2294

1316

2637(889;539;10;16;100;1544;214;102)

Ref

Ref

Sorghum bicolor

10

659

34008

6147(14,9%)

570

1616

159

1717(516;284;2;20;98;1158;68;39)

413(116;16;0;7;5;347;19;3)

24,1%

Zea mays (maize)

10

2365

32540

4454(10,85%)

480

2630

399

1867(558;140;13;15;106;1255;0;45)

319(104;6;2;3;3;261;0;6)

17,1%

Brachypodium distachyon

5

271

25504

8533(20,78%)

467

1473

nd

1662(435;199;2;11;80;1094;0;104)

495(137;19;0;4;7;417;0;1)

29,8%

Monocot Total

-

-

133098

-

2697

8013

1874

7883(2398;1162;27;62;384;5051;282;290)

1227(357;41;2;14;15;1025;19;10)

-

Eudicot

Vitis vinifera (grape)

19

302

21189

Ref

256

892

170

1078(421;229;50;10;37;557;0;91)

Ref

Ref

Arabidopsis thaliana

5

119

33198

2389(11,27%)

564

1407

1105

1559(436;168;125;12;73;1010;3;126)

74(27;0;0;1;0;58;0;2)

4,7%

Populus trichocarpa (poplar)

19

294

30260

4555(21,5%)

212

1229

134

1297(413;122;31;24;63;930;0;32)

122(53;4;1;4;6;89;0;2)

9,4%

Carica papaya

9

234

19205

3199(15,1%)

113

674

nd

703(200;50;13;11;42;515;0;0)

101(45;1;1;1;4;74;0;0)

14,4%

Glycine max (soybean)

20

949

46164

4013(18,94%)

1023

3104

318

3310(1097;411;166;49;179;2172;170;146)

148(51;0;1;3;8;114;6;3)

4,5%

Malus x domestica (apple)

17

742

58979

3498(16,51%)

853

4135

243

4252(1638;860;340;9;123;2292;0;117)

125(41;0;1;1;7;94;0;2)

2,9%

Lotus japonicus

6

500

15470

1720(8,12%)

nd

664

26

668(165;77;49;0;34;443;0;5)

46(18;1;0;0;2;36;0;1)

6,9%

Fragaria vesca (strawberry)

7

240

34809

3289(15,52%)

nd

1452

1

1452(483;154;148;3;52;884;0;0)

108(44;2;1;0;1;89;0;0)

7,4%

Theobroma cacao

10

430

27814

4472(20,1%)

nd

1439

4

1439(492;220;14;4;55;934;0;0)

149(55;3;0;1;10;113;0;0)

10,4%

Eudicot Total

-

-

265899

-

3021

14996

2001

15758(5345;2291;936;122;658;9737;173;517)

873(334;11;5;11;38;667;6;10)

-