From: Similarity evaluation of DNA sequences based on frequent patterns and entropy
current pattern | extended patterns |
---|---|
〈C〉: 7, 10, 14, 16, 17; | 〈CA〉: 8; 〈CC〉: 17; 〈CG〉: Empty; 〈CT 〉: 11, 15, 18; |
〈CT 〉: 11, 15, 18; | 〈CT A〉: Empty; 〈CT C〉: 16; 〈CT G〉: 12, 19; 〈CT T 〉: Empty; |
〈CT G〉: 12, 19; | 〈CTGA〉: 13, 20; 〈CT GC〉: Empty; 〈CT GG〉: Empty; 〈CT GT 〉: Empty; |
〈CTGA〉: 13, 20; | 〈CT GAA〉: Empty; 〈CT GAC〉: 14; 〈CT GAG〉: Empty; 〈CT GAT 〉: Empty; |
〈A〉: 1, 8, 13, 20; | 〈AA〉: Empty; 〈AC〉: 14; 〈AG〉: Empty; 〈AT〉: 2, 9; |
〈AT〉: 2, 9; | 〈AT A〉: Empty; 〈AT C〉: 10; 〈AT G〉: 3; 〈AT T 〉: Empty; |
〈G〉: 3, 4, 6, 12, 19; | 〈GA〉: 13, 20; 〈GC〉: 7; 〈GG〉: 4; 〈GT 〉: 5; |
〈T 〉: 2, 5, 9, 11, 15, 18; | 〈T A〉: Empty; 〈TC〉: 10, 16; 〈T G〉: 3, 6, 12, 19; 〈T T 〉: Empty; |
〈TC〉: 10, 16; | 〈T CA〉: Empty; 〈T CC〉: 17; 〈T CG〉: Empty; 〈T CT 〉: 11; |
〈T G〉: 3, 6, 12, 19; | 〈T GA〉: 13, 20; 〈T GC〉: 7; 〈T GG〉: 4; 〈T GT 〉: Empty; |