From: A class of models for analyzing GeneChip® gene expression analysis array data
Sample ID | Probe | PM (1) | 1 | 2 | ... | k | ... | K |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Covariate | ID | MM(0) | x 1 | x 2 | ... | x k | ... | x K |
ORF1 | 1 | 1 | y 1111 | y 1112 | y 111k | ... | y 111K | |
1 | 0 | y 1101 | y 1102 | y 110k | ... | y 110K | ||
2 | 1 | y 1211 | y 1212 | y 121k | ... | y 121K | ||
2 | 0 | y 1201 | y 1202 | y 120k | ... | y 120K | ||
... | ||||||||
N | 1 | y 1N 11 | y 1N 12 | y 1N 1k | ... | y 1N 1K | ||
N | 0 | y 1N 01 | y 1N 02 | y 1N 0k | ... | y 1N 0K | ||
... | ||||||||
ORF j | 1 | 1 | y j 111 | y j 112 | y j 11k | ... | y j 11K | |
1 | 0 | y j 101 | y j 102 | y j 10k | ... | y j 10K | ||
2 | 1 | y j 211 | y j 212 | y j 21k | ... | y j 21K | ||
2 | 0 | y j 201 | y j 202 | y j 20k | ... | y j 20K | ||
... | ||||||||
i | 1 | y ji 11 | y ji 12 | y ji 1k | ... | y ji 1K | ||
i | 0 | y ji 01 | y ji 02 | y ji 0k | ... | y ji 0K | ||
... | ||||||||
N | 1 | y jN 11 | y jN 12 | y jN 1k | ... | y jN 1K | ||
N | 0 | y jN 01 | y jN 02 | y jN 0k | ... | y jN 0K | ||
... | ||||||||
ORF J | 1 | 1 | y J 111 | y J 112 | y J 11k | ... | y J 11K | |
1 | 0 | y J 101 | y J 102 | y J 10k | ... | y J 10K | ||
2 | 1 | y J 211 | y J 212 | y J 21k | ... | y J 21K | ||
2 | 0 | y J 201 | y J 202 | y J 20k | ... | y J 20K | ||
... | ||||||||
N | 1 | y JN 11 | y JN 12 | y JN 1k | ... | y JN 1K | ||
N | 0 | y JN 01 | y JN 02 | y JN 0k | ... | y JN 0K |