From: Conserved upstream open reading frames in higher plants
In five cereals | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Identifier | uORF1 | uORF2 | uORF3 | uORF4 | uORF5 | Main ORF |
AK106095 | 131_9_17a CCGATGCb | Â | Â | Â | Â | 157_1179 CCCATGG |
AK103391 | 205_75_74 TTGATGA | Â | Â | Â | Â | 354_1116 CAAATGG |
AK100589 | 240_9_334 TGGATGT | 248_156_179 CTAATGG | 296_108_179 TTGATGT | Â | Â | 583_1197 CCAATGG |
AK073303 | 67_9_142 TCCATGC | 135_9_74 CTCATGA | Â | Â | Â | 218_774 AGCATGG |
AK072868 | 249_27_248 GGAATGC | 259_195_70 AAGATGT | 269_39_216 TGCATGC | 338_90_96 TTCATGA | 392_36_96 ACTATGG | 524_1332 GTGATGG |
AK072649 | 100_192_117 CTCATGA | Â | Â | Â | Â | 409_1443 AAGATGG |
AK066145 | 178_12_58 GCTATGG | Â | Â | Â | Â | 248_360 GAGATGG |
AK064792 | 276_15_187 CGGATGC | Â | Â | Â | Â | 478_330 GGAATGG |
AK060523 | 173_123_185 ACTATGG | Â | Â | Â | Â | 481_501 CGGATGG |
In rice and arabidopsis | ||||||
Identifier | uORF1 | uORF2 | uORF3 | uORF4 | uORF5 | Main ORF |
AK101100 | 142_12_21 GCCATGG | Â | Â | Â | Â | 175_1578 AAGATGG |
AK066952 | 365_66_182 CCAATGA | 368_63_182 ATGATGA | 503_51_59 CTGATGA | Â | Â | 613_2085 GGGATGC |
AK119592 | 304_90_148 CCGATGA | Â | Â | Â | Â | 542_1032 GCGATGG |
AK100589 | 248_156_179 CTAATGG | Â | Â | Â | Â | 583_1197 CCAATGG |
AK103391 | 176_30_148 AACATGA | 205_75_74 TTGATGA | Â | Â | Â | 354_1116 CAAATGG |
AK069534 | 813_9_432 TCGATGA | Â | Â | Â | Â | 1254_1602 GAGATGC |
AK069526 | 214_126_544 GATATGG | 690_9_185 TTGATGG | 820_36_28 CATATGA | Â | Â | 884_1455 AAAATGG |
AK072868 | 338_90_96 TTCATGA | Â | Â | Â | Â | 524_1332 GTGATGG |
AK060523 | 173_123_185 ACTATGG | 206_90_185 CCGATGC | Â | Â | Â | 481_501 CGGATGG |
AK067412 | 222_84_49 CTGATGC | Â | Â | Â | Â | 355_1059 GGGATGG |
AK102277 | 228_117_150 TCTATGC | Â | Â | Â | Â | 495_1017 GAAATGG |