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Table 2 Statistical significance of qRT-PCR results for the selected set of 40 genes analyzed

From: Comprehensive identification of sexually dimorphic genes in diverse cattle tissues using RNA-seq

Gene_symbol

Liver

Muscle

Pit.

Fat

ANOVA

Liver

Muscle

Pit.

Fat

ANOVA

ADM

7.30E-02

2.30E-01

6.90E-01

4.70E-01

2.70E-01

1.50E-01

3.00E-01

2.90E-03*

3.50E-03*

5.70E-01

AMPD1

8.50E-01

9.20E-02

4.00E-01

1.40E-01

2.40E-01

1.70E-01

1.30E-01

2.40E-02*

3.00E-01

4.20E-01

APOD

2.60E-02*

1.20E-01

3.40E-01

2.80E-02*

5.00E-02*

7.70E-02

2.30E-01

5.50E-01

6.20E-01

5.60E-02

ARHGEF19

2.90E-02*

1.60E-02*

6.90E-02

5.10E-03*

2.30E-03*

2.80E-01

2.50E-02*

4.70E-01

2.40E-01

4.60E-02*

CATSPER2

8.40E-03*

4.50E-02*

1.00E + 00

1.10E-01

6.50E-03*

6.30E-02

3.10E-01

5.50E-02

8.90E-01

9.30E-01

CGA

1.10E-02*

5.00E-03*

7.00E-02

5.50E-02

1.60E-01

5.40E-02

1.60E-01

2.20E-01

8.30E-04*

1.60E-01

COL27A1

1.90E-01

2.80E-02*

1.20E-02*

9.70E-03*

1.50E-02*

2.30E-01

1.50E-02*

6.00E-01

4.20E-01

9.00E-01

CUX2

6.10E-01

8.90E-04*

8.10E-01

4.20E-01

1.10E-02*

1.70E-02*

5.40E-05*

4.60E-02*

1.30E-01

9.40E-03*

CYP7A1

5.50E-01

1.50E-03*

2.50E-01

9.30E-03*

4.10E-01

4.40E-01

1.50E-01

1.10E-01

5.00E-01

9.50E-01

DBP

5.40E-02

2.40E-04*

4.70E-01

1.60E-01

3.40E-03*

2.90E-01

3.70E-01

2.60E-01

4.50E-02*

7.00E-01

DDX3Y

4.90E-08*

4.40E-06*

2.20E-03*

2.70E-06*

9.90E-22*

6.80E-04*

4.30E-02*

1.00E-05*

2.20E-08*

1.10E-14*

DOCK6

4.60E-02*

5.60E-02

6.90E-02

8.80E-01

6.00E-02

2.40E-01

4.70E-01

3.90E-02*

5.60E-01

1.10E-01

EPYC

5.80E-01

5.50E-01

3.90E-03*

1.50E-04*

1.30E-04*

1.90E-02*

1.50E-02*

9.70E-01

5.50E-02

7.70E-02

FTCD

2.30E-02*

8.40E-05*

3.40E-02*

4.90E-01

5.90E-05*

NA

3.70E-01

2.30E-03*

NA

7.60E-01

GABBR1

5.40E-01

2.70E-02*

4.60E-02*

6.50E-03*

6.10E-01

6.80E-02

4.90E-01

9.10E-01

2.40E-01

1.90E-01

GNAL

7.00E-01

5.70E-01

1.00E-01

4.20E-03*

3.00E-01

3.20E-01

4.30E-01

6.10E-01

4.80E-01

6.00E-01

HOXD4

8.50E-01

5.70E-01

8.30E-01

NA

5.10E-01

3.30E-01

1.30E-02*

4.30E-01

1.20E-01

1.60E-02*

HTRA1

4.60E-02*

5.80E-01

2.00E-01

3.70E-02*

5.50E-01

4.80E-01

4.20E-01

4.90E-02*

2.30E-01

3.30E-01

IGFBP1

1.90E-03*

8.10E-03*

7.50E-03*

1.00E-02*

6.70E-10*

NA

2.80E-01

4.20E-02*

8.40E-02

3.20E-01

ME2

1.40E-01

3.10E-01

2.90E-01

6.70E-01

7.80E-02

6.60E-01

4.60E-01

1.70E-01

1.30E-01

4.00E-01

MYH1

9.80E-02

4.20E-03*

1.70E-03*

1.30E-03*

2.90E-02*

1.80E-02*

NA

3.10E-01

1.50E-02*

1.40E-01

NRBP2

4.40E-01

1.20E-01

9.40E-03*

9.10E-01

1.80E-02*

3.80E-02*

3.80E-01

3.60E-02*

2.10E-01

1.20E-01

PPP1R3A

1.00E-01

5.40E-03*

6.00E-01

7.00E-01

4.80E-01

4.80E-02*

3.70E-01

8.40E-02

4.40E-01

4.70E-02*

RAB3C

2.30E-02*

4.60E-05*

7.30E-01

6.10E-03*

2.20E-02*

1.00E-02*

3.70E-01

NA

6.10E-01

8.40E-02

RBM38

3.90E-02*

5.60E-03*

6.60E-01

2.30E-02*

5.60E-04*

1.90E-02*

5.00E-01

2.20E-03*

8.40E-03*

2.30E-01

RGS2

2.70E-02*

6.40E-05*

6.70E-01

6.20E-01

1.60E-03*

2.30E-02*

3.40E-01

7.20E-01

4.30E-01

1.70E-01

RGS7

3.40E-01

1.00E-06*

8.40E-01

8.30E-01

5.20E-03*

3.40E-02*

4.90E-01

7.50E-01

7.70E-02

6.90E-01

RGS9

9.20E-01

5.60E-01

3.70E-01

2.10E-01

5.80E-01

2.00E-01

4.40E-01

4.60E-02*

9.10E-03*

6.80E-01

SCN8A

5.60E-02

2.50E-01

NA

NA

7.30E-01

5.10E-01

4.10E-01

9.80E-01

3.40E-02*

5.50E-01

SCN9A

3.80E-02*

1.80E-02*

7.00E-01

7.50E-01

1.50E-02*

5.90E-03*

4.50E-01

5.80E-03*

6.80E-04*

4.40E-02*

SLC17A3

1.60E-02*

5.20E-01

1.00E-02*

4.60E-02*

4.40E-05*

NA

3.40E-01

NA

NA

2.90E-01

SLC6A15

5.90E-02

NA

NA

9.80E-01

9.30E-02

3.80E-01

3.70E-01

NA

3.90E-02*

3.80E-01

STXBP5L

4.10E-02*

2.70E-01

8.90E-01

1.50E-01

2.90E-01

NA

5.80E-01

6.10E-01

6.80E-02

6.00E-01

TBL1X

6.40E-01

2.80E-02*

9.00E-01

4.20E-02*

8.10E-03*

6.00E-01

3.80E-01

7.20E-02

8.90E-01

2.80E-01

TMEM59L

7.80E-01

9.80E-02

5.80E-02

2.70E-02*

9.50E-02

4.40E-02*

3.10E-01

4.50E-01

1.50E-02*

5.30E-01

TNNC1

8.60E-01

4.10E-01

4.90E-02*

1.50E-01

1.00E + 00

6.50E-01

4.40E-01

2.50E-03*

8.30E-01

6.40E-01

TNNT3

1.50E-02*

6.40E-01

3.50E-02*

6.90E-02

1.20E-03*

2.10E-02*

3.20E-01

3.90E-02*

6.10E-02

1.80E-01

UCP3

NA

3.60E-01

9.80E-01

1.00E-01

8.10E-02

4.40E-02*

5.10E-01

6.80E-01

1.30E-02*

6.00E-01

USP9Y

5.70E-06*

2.70E-05*

8.20E-04*

7.90E-05*

2.30E-20*

NA

9.30E-01

5.70E-01

6.50E-04*

4.10E-01

ZNF280B

5.00E-03*

9.40E-05*

2.90E-03*

1.10E-03*

4.00E-12*

1.60E-01

3.60E-01

3.30E-02*

3.50E-01

2.20E-01

Experiment

qRT-PCR in cattle

qRT-PCR in rat

  1. (*) significant genes at P-value < 0.05
  2. NA value represents non-measured expression in the qRT-PCR
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BMC Genomics

ISSN: 1471-2164

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