PQS group | Total # PQSs in group | # PQSs with total loop length ≤7 | # of 1 or 2 nucleotide loops | # single pyrimidine (not purine) loops | # PQSs with a longest-central loop | |
---|---|---|---|---|---|---|
1Â nt | 2Â nt | |||||
Var-associated | 35 | 2 (5.7Â %) | 4 (3.8Â %) | 4 (3.8Â %) | 4 (3.8Â %) | 23 (65.7Â %) |
Non-var-associated | 45 | 13 (28.9Â %) | 23 (17.0Â %) | 18 (13.3Â %) | 2 (1.5Â %) | 9 (20Â %) |
Total | 80 | 15 (18.8Â %) | 27 (11.3Â %) | 22 (9.2Â %) | 6 (2.5Â %) | 32 (40Â %) |
Signif. difference? |  | Y | Y | N | Y | |
p-value | Â | 0.0095 | <0.0001 | 0.3959 | <0.0001 |