Table 1 LncRNAs and its potential target genes that are involved in hair follicle cycling
Protein-coding genes | lncRNA in cis | lncRNA in Trans |
|---|---|---|
Wnt related | ||
 wnt3 |  | LNC_000211, LNC_000126, LNC_000701, LNC_000826 |
 wnt3a | LNC_000972 |  |
 wnt10a |  | LNC_000157, LNC_000640 |
 APC |  | LNC_000814, LNC_000856, LNC_000924, LNC_001044, LNC_000471, LNC_000638 |
 ctnnb1 |  | LNC_000123, LNC_000194, LNC_000196, LNC_000217, LNC_000542, LNC_000693, LNC_00924, LNC_001012, LNC_001024 |
 Tcf3 |  | LNC_000519, LNC_000643 |
 Tcf4 |  | LNC_000662, LNC_000728 |
 DKK3 |  | LNC_000945, LNC_000971 |
BMP/TGFβ related | ||
 TGFB1 |  | LNC_000294 |
 TGFBR1 | LNC_001012 |  |
 BMPR1a |  | LNC_001050 |
 FST |  | LNC_000074 |
 BMP4 |  | LNC_000038, LNC_000178, LNC_000808 |
Shh related | ||
 DHH | LNC_000918 | LNC_000544 |
 Gli1 |  | LNC_000633 |
 Gli3 | LNC_000842 | LNC_000222, LNC_001006 |
Notch related | ||
 notch2 |  | LNC_000577, LNC_000178 |
 RBPJ |  | LNC_001052 |
 Hey1 |  | LNC_000142 |
 Hey2 | LNC_001057 |  |
 DLK2 |  | LNC_000820, LNC_000834 |
FGF/EGF related | ||
 FGF10 |  | LNC_000037 |
 FGF18 |  | LNC_000689 |
 FGFR2 |  | LNC_000176, LNC_000445, LNC_000999, LNC_000662, LNC_000914 |
 TGFa |  | LNC_000885 |
Transcription factors | ||
 Runx1 |  | LNC_000222, LNC_000577, LNC_000825 |
 sox9 | LNC_000446 | LNC_000648, LNC_000727 |
 LHX2 | LNC_000185 | LNC_000398,LNC_000422 |
 Dlx3 |  | LNC_000708 |
 Msx2 | LNC_000503 | LNC_000287, LNC_000385, LNC_001041 |
 Gata3 |  | LNC_000181 |
 Tp63 |  | LNC_000409, LNC_000516, LNC_001040 |
 Foxn1 |  | LNC_000164, LNC_000205, LNC_000316, LNC_000694 |
 Hoxc13 | LNC_000881 | LNC_000269, LNC_000168 |