Significant ionomic changes in yeast with gene knockout in haploid background | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Element being regulated | Gene | Gene | Group | Ca | Cd | Co | Cu | Fe | K | Mg | Mn | Mo | Na | Ni | P | S | Zn | |||
Ca | YNL323W | LEM3 | B | 7.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Ca | YOL052C | SPE2 | B | 6.32 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Ca | YGR162W | TIF4631 | B | 4.34 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Ca | YBL047C | EDE1 | B | 4.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Ca | YBL094C | Â | B | 4.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Na | YNR051C | BRE5 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.87 | - | - | - | - | |||
Na | YOR039W | CKB2 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.33 | - | - | - | - | |||
K | YJL179W | PFD1 | B | - | - | - | - | - | 4.99 | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
K | YLR242C | ARV1 | B | - | - | - | - | - | 4.31 | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Mg & P [Ni trend] | YPL179W | PPQ1 | B | - | - | - | - | - | - | 19.50 | - | - | - | - | 5.70 | - | - | |||
Mg & P [Ni trend] | YGR129W | SYF2 | B | - | - | - | - | - | - | 9.28 | - | - | - | - | 8.61 | - | - | |||
S | YBR279W | PAF1 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 8.15 | - | |||
S | YPL178W | CBC2 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 7.94 | - | |||
S | YIL097W | FYV10 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.79 | - | - | 7.88 | - | |||
S | YIL165C | Â | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 7.00 | - | |||
S | YIL155C | GUT2 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 6.71 | - | |||
Mo [surrogate Fe] | YBR081C | SPT7 | C | - | - | - | - | - | - | - | - | 8.47 | - | - | - | - | - | |||
Mo [surrogate Fe] | YCR084C | TUP1 | C | - | - | - | - | - | - | - | - | 7.97 | - | - | - | - | - | |||
Mo [surrogate Fe] | YGR257C | MTM1 | C | - | - | - | - | - | - | - | - | 6.97 | - | - | - | - | - | |||
Mo [surrogate Fe] | YGL066W | SGF73 | C | - | - | - | - | - | - | - | - | 6.86 | - | - | - | - | - | |||
Mo [surrogate Fe] | YBR112C | CYC8 | C | - | - | - | - | - | - | - | - | 6.73 | - | - | - | - | - | |||
Mn & Cd | YLR034C | SMF3 | B | - | 4.50 | - | - | - | - | - | 8.48 | - | - | - | - | - | - | |||
Mn & Cd | YDR322W | MRPL35 | B | - | 7.15 | - | - | - | - | - | 5.27 | - | - | - | - | - | - | |||
Mn & Cd | YNR006W | VPS27 | B | - | 6.34 | - | - | - | - | - | 4.98 | - | - | - | - | - | - | |||
Mn & Cd | YGL124C | MON1 | B | - | 7.36 | - | - | - | - | - | 4.18 | - | - | - | - | - | - | |||
Mn & Cd | YGR089W | NNF2 | B | - | 3.78 | - | - | - | - | - | 3.95 | - | - | - | - | - | - | |||
Mn | YEL050C | RML2 | B | - | - | - | - | - | - | - | −6.95 | - | - | - | - | - | - | |||
Mn | YCR024C | SLM5 | B | - | - | - | - | - | - | - | −4.74 | - | - | - | - | - | - | |||
Mn | YDR477W | SNF1 | B | - | - | - | - | - | - | - | −4.39 | - | - | - | - | - | - | |||
Cd | YGL095C | VPS45 | B | - | 10.49 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Cd | YKL041W | VPS24 | B | - | 8.61 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Cd | YBL024W | NCL1 | B | - | 8.61 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Cd | YOR036W | PEP12 | B | - | 7.80 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Cd | YML097C | VPS9 | B | - | 7.27 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Significant ionomic changes in yeast with single copy gene knockouts in diploid background | ||||||||||||||||||||
Element being regulated | Line | Name | Group | Ca | Cd | Co | Cu | Fe | K | Mg | Mn | Mo | Na | Ni | P | S | Zn | |||
Ca | YJL111W | CCT7 | B | 3.96 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Ca | YER125W | RSP5 | B | 4.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Na | YGL097W | SRM1 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | −7.22 | - | - | - | - | |||
Na | YLR197W | NOP56 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | −3.67 | - | - | - | - | |||
Mg | YIL033C | BCY1 | B | - | - | - | - | - | - | −5.09 | - | - | - | - | - | - | - | |||
Mg | YDL145C | COP1 | A | - | - | - | - | - | - | 4.41 | - | - | - | - | - | - | - | |||
Mg | YDR188W | CCT6 | A | - | - | - | - | - | - | 5.20 | - | - | - | - | - | - | - | |||
Mo | YKL059C | MPE1 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.11 | - | - | - | - | - | |||
Mo | YGL150C | INO80 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.59 | - | - | - | - | - | |||
Mo | YJR057W | CDC8 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.61 | - | - | - | - | - | |||
Mo | YDL003W | MCD1 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.01 | - | - | - | - | - | |||
Cd | YGL112C | TAF6 | B | - | 3.92 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Cd | YLR293C | GSP1 | A | - | 4.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Cd | YML093W | UTP14 | B | - | 4.35 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Mn | YNL112W | DBP2 | B | - | - | - | - | - | - | - | 4.49 | - | - | - | - | - | - | |||
Mn | YNL062C | GCD10 | B | - | - | - | - | - | - | - | 7.29 | - | - | - | - | - | - | |||
Significant ionomic changes in yeast with single open reading frame over expressed | ||||||||||||||||||||
Element being regulated | Line | Name | Group | As | Ca | Cd | Cl | Co | Cu | Fe | K | Mg | Mn | Mo | Na | Ni | P | S | Se | Zn |
Na | YOR071C | NRT1 | C | - | 5.41 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 23.54 | - | - | - | - | - |
Na | YOR106W | VAM3 | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 7.96 | - | - | - | - | - |
Na | YDR281C | PHM6 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 7.06 | - | - | - | - | - |
Ca | YER068W | MOT2 | B | - | 7.87 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Ca | YGR027C | RPS25A | B | - | 6.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Ca | YGL163C | RAD54 | B | - | 5.86 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Ca | YLR196W | PWP1 | B | - | 5.26 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
K | YPR138C | MEP3 | A | - | - | - | - | - | - | - | −4.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Mg & Ni | YPL031C | PHO85 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.85 | - | 4.93 | - | 4.52 | - | - | - | - |
Mo [Fe] | YLR013W | GAT3 | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 15.8 | - | - | - | - | - | - |
Mo [Fe] | YDR222W | Â | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.26 | - | - | - | - | - | - |
Mo [Fe] | YPL089C | RLM1 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.20 | - | - | - | - | - | - |
Mo [Fe] | YIL079C | AIR1 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.69 | - | - | - | - | - | - |
Mo [Fe] | YMR235C | RNA1 | B | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.94 | - | - | - | - | - | - |
Cu | YDR441C | APT2 | B | - | - | - | - | - | 9.42 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Cu | YIL118W | RHO3 | B | - | - | - | - | - | 4.80 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Cu | YNL201C | PSY2 | B | - | - | - | - | - | 4.77 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Cu | YPR009W | SUT2 | B | - | - | - | - | - | 4.76 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Mn | YCL022C |  |  | - | - | - | - | - | - | - | - | - | −4.25 | - | - | - | - | - | - | - |
Cd | YJL031C | BET4 | B | - | - | 5.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Cd | YDR452W | PPN1 | B | - | - | 4.46 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Cd | YDL055C | PSA1 | B | - | - | 4.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |