Table 3 Distribution of the mt protein-coding gene and trn gene among trebouxiophycean algae and chlorophycean algae
From: Plastid and mitochondrion genomic sequences from Arctic Chlorella sp. ArM0029B
| Â | Trebouxiophyceae | Chlorophyceae | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Â | ArM0029B | Prototheca | Helicosporidium | Coccomyxa | MX-AZ01 | Scenedesmus | Dunaliella | Gonium | Chlamydomonas |
atp1 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
atp4 | o | - | o | o | o | - | - | - | - |
atp6 | o | o | o | o | o | o | - | - | - |
atp8 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
atp9 | o | o | o | o | o | o | - | - | - |
cob | o | o | o | o | o | o | o | o | o |
cox1 | o | o | o | o | o | o | o | o | o |
cox2 | o | o | o | o | o | o | - | - | - |
cox3 | o | o | o | o | o | o | - | - | - |
nad1 | o | o | o | o | o | o | o | o | o |
nad2 | o | o | o | o | o | o | o | o | o |
nad3 | o | o | o | o | o | o | - | - | - |
nad4 | o | o | o | o | o | o | o | o | o |
nad4L | o | o | o | o | o | o | - | - | - |
nad5 | o | o | o | o | o | o | o | o | o |
nad6 | o | o | o | o | o | o | o | o | o |
nad7 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
nad9 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
rpl5 | o | - | o | o | o | - | - | - | - |
rpl6 | o | o | o | - | - | - | - | - | - |
rpl16 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
rps2 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
rps3 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
rps4 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
rps7 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
rps10 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
rps11 | o | o | o | - | - | - | - | - | - |
rps12 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
rps13 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
rps14 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
rps19 | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
tatC | o | o | o | o | o | - | - | - | - |
size | 65,049 | 55,328 | 49,343 | 65,497 | 74,423 | 42,781 | 28,331 | 15,993 | 15,758 |
tRNAs | Trebouxiophyceae | Chlorophyceae | |||||||
| Â | ArM0029B | Prototheca | Helicosporidium | Coccomyxa | MX-AZ01 | Scenedesmus | Dunaliella | Gonium | Chlamydomonas |
trnA (UGC) | o | o | o | o | o | o | _ | _ | _ |
trnC (GCA) | o | o | o | o | o | o | _ | _ | _ |
trnD (GUC) | o | o | o | o | o | o | _ | _ | _ |
trnE (UUC) | o | o | o | o | o | o | _ | _ | _ |
trnF (GAA) | o | o | o | o | o | o | _ | _ | _ |
trnG (GCC) | o | o | _ | o | o | _ | _ | _ | _ |
trnG (UCC) | o | o | o | o | _ | o | _ | _ | _ |
trnH (GUG) | o | o | o | o* | o* | o | _ | _ | _ |
trnI (CAU) | o | o | o | o | o | _ | _ | _ | _ |
trnI (GAU) | o | o | o | o | o | o | _ | _ | _ |
trnI (UAU) | _ | _ | _ | _ | _ | o | _ | _ | _ |
trnK (UUU) | o | o | o | o | o | o | _ | _ | _ |
trnL (AAG) | _ | _ | _ | _ | _ | o | _ | _ | _ |
trnL (CAA) | o | _ | _ | o | o | _ | _ | _ | _ |
trnL (CAG) | _ | _ | _ | _ | _ | o | _ | _ | _ |
trnL (UAA) | o | o | o | o | o | _ | _ | _ | _ |
trnL (UAG) | o | o | o | o | o | _ | _ | _ | _ |
trnM (CAU) | oo | oo | oo | oo | o | oo | o | oo | o |
trnN (GUU) | o | o | o | o | o | o | _ | _ | _ |
trnP (UGG) | o | o | o | o | _ | o | _ | _ | _ |
trnQ (UUG) | o | o | o | o | o | o | o | o | o |
trnR (ACG) | o | o | o | o | _ | o | _ | _ | _ |
trnR (CCU) | _ | _ | _ | _ | _ | o | _ | _ | _ |
trnR (UCU) | o | o | o | o | o | o | _ | _ | _ |
trnS (GCU) | o | o | o | o* | o* | o | _ | _ | _ |
trnS (GGA) | _ | _ | _ | _ | _ | o | _ | _ | _ |
trnS (UGA) | o | o | o | o* | o* | _ | _ | _ | _ |
trnT (UGU) | o | o | o | _ | _ | _ | _ | _ | _ |
trnV (UAC) | o | o | o | o | o | o | _ | _ | _ |
trnW (CCA) | o | o | o | o* | o* | o | o | o | o |
trnW (CUA) | _ | _ | _ | _ | _ | o | _ | _ | _ |
trnY (GUA) | o | o | o | o | o | o | _ | _ | _ |
Total number | 27 | 26 | 25 | 26 | 23 | 27 | 3 | 4 | 3 |