DNA Target 5′ → 3′ | References from Literature | Experimentally Found ZFP | Best prediction made by ZiFNN | Identity for ZiFNN | ZiFit Prediction | Identity for ZiFiT | Zinc Finger Tools | Identity for Zinc Finger Tools | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
F1 | F2 | F3 | F1 | F2 | F3 | F1 | F2 | F3 | ||||||
GTGGAGGAA | [57] | QSGNLTRRSGHLTRRSGELTR | DSGHLTRDSGHLTRDSGHLTR | 0.76 | RNVNLVTRQDNLGRQASNLLR | 0.33 | RSDELVRRSDNLVRQSSNLVR | 0.47 | ||||||
GCTGCTGCT | [58] | RSGELTRTSGELTRRSGELTR | TSGELTETSGELTETSGELTE | 0.76 | LRASLRRQRSDLTRMKNTLTR | 0.38 | TSGELVRTSGELVRTSGELVR | 0.76 | ||||||
GAGGAGGAT | [59] | QSGNLTRRSGNLTRRSGNLTR | QSGHLTRQSGHLTRQSGHLTR | 0.76 | - | - | RSDNLVRRSDNLVRTSGNLVR | 0.66 | ||||||
CTGGCGGCA | [60] | RSGALTERSGDLTRQSGDLTR | RSGDLTTRSGDLTTRSGDLTT | 0.76 | - | - | RNDALTERSDDLVRQSGDLRR | 0.76 | ||||||
GGGGCGGGG | [61] | KSGHLTARSGELTRRSGHLTK | RSGHLTRRSGHLTRRSGHLTR | 0.80 | RKHRLDGRTDTLARRGNHLRR | 0.33 | RSDKLVRRSDDLVRRSDKLVR | 0.42 | ||||||
GCTGGGGGC | [62] | RSGELTRTSGHLTRDSGHLTR | QSGHLTRQSGHLTRQSGHLTR | 0.80 | VSNSLARRREHLVRTNSKLTR | 0.42 | TSGELVRRSDKLVRDPGHLVR | 0.61 | ||||||
GCGTGGGGA | [63] | RSGELTRRSGHLTRQSGHLTR | QSGTLTRRSGTLTRQSGTLTR | 0.80 | - | - | RSDDLVRRSDHLTTQRAHLER | 0.61 | ||||||
GCGTGGGCA | [64] | RSGELTRRSGHLTRRSGELTR | RSGTLTRRSGTLTRRSGTLTT | 0.80 | - | - | RSDDLVRRSDDLVRQSGDLRR | 0.57 | ||||||
GCGTGGGAA | [63] | RSGELTRRSGHLTRQSGNLTR | RSGTLTRRSGTLTRRSGTLTR | 0.80 | - | - | RSDDLVRRSDHLTTQSSNLVR | 0.66 | ||||||
GCGGGCCGC | [65] | RSGELTRDSGALTRRSGELTR | RSGHLTRRSGHLTRRSGHLTR | 0.80 | - | - | RSDDLVRDPGHLVRHTGHLLE | 0.47 | ||||||
GCAGCGGAC | [62] | RSGELTRRSGHLTRQSGSLTR | QSGHLTRQSGHLTRQSGHLTR | 0.80 | QKGTLGRRTDTLARDPSNLIR | 0.38 | QSGDLRRRSDDLVRDPGNLVR | 0.52 | ||||||
GAGGAAGGG | [59] | RSGHLTRQSGNLTRRSGNLTR | QSGHLTRQSGHLTRQSGHLTR | 0.80 | RRDNLNRQQTNLTRKRERLDR | 0.48 | RSDNLVRQSSNLVRRSDKLVR | 0.61 | ||||||
ACTACTGGA | [60] | TSGDLTRTSGDLTRQSGHLTR | TSGELTRTSGELTRTSGELTR | 0.80 | - | - | THLDLIRTHLDLIRQRAHLER | 0.57 | ||||||
GCTGGGGGC | [62] | QSGDLTRRSGHLTRDSGHLTR | QSGHLTRQSGHLTRQSGHLTR | 0.85 | VSNSLARRREHLVRTNSKLTR | 0.48 | TSGELVRRSDKLVRDPGHLVR | 0.61 | ||||||
GAAGAGGGT | [59] | QSGHLTRRSGNLTRQSGNLTR | QSGHLTRQSGHLTRQSGHLTR | 0.85 | QRNNLGRRQDNLGRTRQKLET | 0.38 | QSSNLVRRSDNLVRTSGHLVR | 0.61 | ||||||
GAGGAAGGT | [66] | TSGHLTRTSGHLTRRSGELTR | TSGHLTRTSGHLTRTSGHLTR | 0.90 | RRDNLNRQQTNLTRTKQRLEV | 0.28 | RSDNLVRQSSNLVRTSGHLVR | 0.47 | ||||||
 |  |  | Average for ZifNN | 0.81 | Average For ZiFit | 0.38 | Average for Zinc Finger Tool | 0.58 |