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Table 3 34 identified OGs based on comparison of five examined species

From: Genome-wide comparison reveals divergence of cassava and rubber aquaporin family genes after the recent whole-genome duplication

Group

OG

Cassava

Rubber

Castor

Physic nut

Poplar

PIP1

1-1a

MePIP1;1

HbPIP1;4

RcPIP1;4

JcPIP1;2

PtPIP1;3

MePIP1;2

HbPIP1;3

PIP1

1-1b

MePIP1;3

HbPIP1;2

RcPIP1;2

RcPIP1;3

JcPIP1;1

PtPIP1;1

PtPIP1;2

MePIP1;4

HbPIP1;1

PIP1

1-1c

RcPIP1;1

PtPIP1;4

PtPIP1;5

PIP1

1-1d

HbPIP1;5

RcPIP1;5

JcPIP1;4

PIP2

1-2a

MePIP2;1

HbPIP2;1

RcPIP2;1

JcPIP2;1

PtPIP2;5

PtPIP2;6

PtPIP2;7

MePIP2;2

HbPIP2;2

PIP2

1-2b

MePIP2;3

HbPIP2;5

RcPIP2;2

JcPIP2;2

PtPIP2;3

PtPIP2;4

MePIP2;4

HbPIP2;6

PIP2

1-2c

MePIP2;5

HbPIP2;4

RcPIP2;3

JcPIP2;3

PtPIP2;8

MePIP2;6

HbPIP2;3

PIP2

1-2d

MePIP2;7

HbPIP2;7

RcPIP2;4

JcPIP2;4

PtPIP2;1

PtPIP2;2

MePIP2;8

HbPIP2;8

PIP2

1-2e

MePIP2;9

HbPIP2;9

PIP2

1-2f

MePIP2;10

HbPIP2;10

RcPIP2;5

JcPIP2;5

PtPIP2;9

PtPIP2;10

TIP1

2-1a

MeTIP1;1

HbTIP1;2

RcTIP1;1

JcTIP1;1

PtTIP1;5

PtTIP1;6

MeTIP1;2

HbTIP1;1

TIP1

2-1b

HbTIP1;3

HbTIP1;4

RcTIP1;4

JcTIP1;4

PtTIP1;7

PtTIP1;8

TIP1

2-1c

MeTIP1;3

HbTIP1;6

RcTIP1;2

JcTIP1;2

PtTIP1;4

PtTIP1;3

MeTIP1;4

HbTIP1;5

TIP1

2-1d

MeTIP1;5

HbTIP1;8

RcTIP1;3

JcTIP1;3

PtTIP1;1

PtTIP1;2

MeTIP1;6

HbTIP1;7

TIP2

2-2a

MeTIP2;1

HbTIP2;1

HbTIP2;2

RcTIP2;1

JcTIP2;1

PtTIP2;1

PtTIP2;2

TIP2

2-2b

MeTIP2;2

HbTIP2;3

RcTIP2;2

JcTIP2;2

PtTIP2;3

PtTIP2;4

MeTIP2;3

HbTIP2;4

TIP3

2–3

MeTIP3;1

HbTIP3;1

RcTIP3;1

JcTIP3;1

PtTIP3;2

PtTIP3;1

MeTIP3;2

HbTIP3;2

TIP4

2–4

MeTIP4;1

HbTIP4;1

RcTIP4;1

JcTIP4;1

PtTIP4;1

TIP5

2–5

MeTIP5;1

HbTIP5;1

HbTIP5;2

RcTIP5;1

JcTIP5;1

PtTIP5;1

PtTIP5;2

NIP1

3–1

MeNIP1;1

HbNIP1;1

RcNIP1;1

JcNIP1;1

PtNIP1;1

PtNIP1;2

MeNIP1;2

HbNIP1;2

NIP2

3–2

MeNIP2;1

HbNIP2;1

RcNIP2;1

JcNIP2;1

PtNIP2;1

NIP3

3-3a

MeNIP3;1

HbNIP3;1

RcNIP3;1

JcNIP3;1

PtNIP3;1

NIP3

3-3b

MeNIP3;2

MeNIP3;3

JcNIP3;2

NIP4

3-4a

HbNIP4;1

RcNIP4;1

PtNIP4;1

NIP4

3-4b

HbNIP4;2

RcNIP4;2

JcNIP4;1

PtNIP4;2

NIP5

3–5

MeNIP5;1

HbNIP5;1

RcNIP5;1

JcNIP5;1

PtNIP5;1

PtNIP5;2

NIP6

3–6

MeNIP6;1

HbNIP6;1

RcNIP6;1

JcNIP6;1

PtNIP6;1

PtNIP6;2

NIP7

3–7

MeNIP7;1

HbNIP7;1

RcNIP7;1

JcNIP7;1

PtNIP7;1

XIP1

4–1

MeXIP1;1

HbXIP1;1

RcXIP1;1

RcXIP1;2

RcXIP1;3

RcXIP1;4

JcXIP1;1

PtXIP1;1

XIP2

4–2

MeXIP2;1

HbXIP2;1

RcXIP2;1

JcXIP2;1

PtXIP2;1

XIP3

4–3

MeXIP3;1

MeXIP3;2

HbXIP3;1

RcXIP3;1

PtXIP3;1

PtXIP3;2

PtXIP3;3

SIP1

5-1a

MeSIP1;1

HbSIP1;2

HbSIP1;3

RcSIP1;1

JcSIP1;1

PtSIP1;1

PtSIP1;2

SIP1

5-1b

HbSIP1;1

RcSIP1;2

RcSIP1;3

JcSIP1;2

JcSIP1;3

PtSIP1;3

PtSIP1;4

SIP2

5–2

MeSIP2;1

HbSIP2;1

RcSIP2;1

JcSIP2;1

PtSIP2;1

PtSIP2;2

  1. OGs that are limited to rubber and cassava were shown in black. (OG orthologous group)